制药工程专业培养适应社会主义建设需要的、德智体全面发展的、掌握制药工程与工艺宽厚的基础理论和专业知识，既具有丰富坚实的药理知识，又具有药物设计、合成、产品分离与提纯、生产工艺设计与放大、药物制剂等方面的综合知识，具有一定的技术经济及管理知识、了解学科发展前沿，获得工程师基本训练的制药工程高级工程技术人才。
制药工程专业是药学和工程学交叉结合发展的应用学科，是利用化学、药学、工程学、管理学及相关科学理论和技术手段实现制造药物的实践过程，既是工程技术的一个分支，又是药学的重要组要部分。通过学习能够解决药品生产过程中的工程技术，包括新工艺,新设备，新品种的开发、放大、设计、质控与优化等问题，应培养具有现代制药工程基本理论与基本技术知识，能在医药、精细化工,生物制药等部门从事产品生产、科技开发、应用研究和制药管理方面的高级工程技术人才。毕业生应获得以下几方面的知识和能力：
（1）掌握化学制药、生物制药、中药制药、药物制剂技术与工程的基本理论和基本知识。
（2）掌握药物生产装置工艺与设备设计方法。
（3）具有对药品的新资源、新产品、新工艺进行研究、开发和设计的初步能力。
（4）熟悉国家对于化工与制药生产、设计、研究与开发、环境保护等方面的方针、政策和法规。
（5）了解制药工程与制剂方面的理论前沿，了解新工艺、新技术和新设备的发展动态。
（6）掌握文献检索、资料查询的基本方法，具有一定的科学研究和实际工作能力。
（7）具有一定的人文社会科学和科学技术素质类基本知识；具备从事专业业务工作的能力和适应相邻专业业务工作的基本能力与素质；具有一定的外语、计算机知识和大学生文化素质知识及军事理论知识。
（8）具有一定的创新意识和独立获取新知识的能力。